Tek nükleotid varyantları (SNV'ler) içeren iki VCF dosyasını karşılaştırmak için bcftools isec kullanabileceğimi biliyorum; dört olası çıktı dosyası oluşturacaktır: biri dosya 1'de tüm benzersiz olarak adlandırılan SNV'lerle, biri dosya 2'de tüm benzersiz olarak adlandırılan SNV'lerle, biri de dosya 2'de bulunan dosya 1'deki tüm SNV'leri içeren son olarak 2. dosyadaki tüm SNV'leri 1. dosyada bulunan bir tane.

Birinin iki VCF dosyası arasındaki yapısal varyantları (SV'ler) karşılaştırmasına izin verecek benzer türde bir araç var mı? Bu hesaplamayı gerçekleştirmek için Perl komut dosyalarımdan birini (şu anda VCF.pm Perl modülünü kullanan) ince ayar yapmak üzereyim (çünkü şimdiye kadar SV'ler için tasarlanmış herhangi bir araç bulamadım), ancak soracağımı düşündüm başka birinin bu tekerleği icat etmiş olması durumunda bu forum.